Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119 ms