Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms