Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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