Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DmdP11531 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DmdP11531 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DmdP11531 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DmdP11531 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DmdP11531 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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DmdP11531 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
DmdP11531 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
DmdP11531 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DmdP11531 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DmdP11531 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DmdP11531 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DmdP11531 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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DmdP11531 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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DmdP11531 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DmdP11531 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
DmdP11531 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DmdP11531 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DmdP11531 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DmdP11531 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DmdP11531 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DmdP11531 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DmdP11531 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DmdP11531 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DmdP11531 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
DmdP11531 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
DmdP11531 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
DmdP11531 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DmdP11531 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DmdP11531 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DmdP11531 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DmdP11531 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DmdP11531 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DmdP11531 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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DmdP11531 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DmdP11531 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DmdP11531 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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DmdP11531 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
DmdP11531 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DmdP11531 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DmdP11531 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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DmdP11531 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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DmdP11531 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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DmdP11531 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DmdP11531 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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DmdP11531 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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DmdP11531 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DmdP11531 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DmdP11531 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DmdP11531 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DmdP11531 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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DmdP11531 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
DmdP11531 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DmdP11531 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DmdP11531 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DmdP11531 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DmdP11531 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
DmdP11531 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DmdP11531 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DmdP11531 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
DmdP11531 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
DmdP11531 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DmdP11531 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DmdP11531 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms