Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms