Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ptpn20O55082 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms