Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DffaO54786 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DffaO54786 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms