Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms