Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Casq1O09165 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Casq1O09165 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Casq1O09165 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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