Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Usp35M0QWN7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Usp35M0QWN7 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Usp35M0QWN7 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Usp35M0QWN7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Usp35M0QWN7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Usp35M0QWN7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Usp35M0QWN7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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