Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm4340L7N2C4 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm4340L7N2C4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm4340L7N2C4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm4340L7N2C4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm4340L7N2C4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm4340L7N2C4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm4340L7N2C4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm4340L7N2C4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm4340L7N2C4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm4340L7N2C4 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm4340L7N2C4 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm4340L7N2C4 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm4340L7N2C4 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm4340L7N2C4 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm4340L7N2C4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm4340L7N2C4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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