Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm44706-201ENSMUST00000206822 815 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm34099-201ENSMUST00000211592 704 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 CT009721.1-201ENSMUST00000213590 770 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Olfr371-202ENSMUST00000218663 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 AC154849.1-201ENSMUST00000224873 960 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Dnajc5b-201ENSMUST00000029132 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Iba57-202ENSMUST00000069631 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Pkd2l2-202ENSMUST00000166156 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm26773-201ENSMUST00000180772 2868 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Spata7-202ENSMUST00000101144 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 4931431C16Rik-201ENSMUST00000124643 2735 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gimap8-203ENSMUST00000203509 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Pear1-216ENSMUST00000174759 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms