Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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