Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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