Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Taf4E9QAP7 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms