Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3G8

Nup153, Nucleoporin 153, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup153E9Q3G8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup153E9Q3G8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup153E9Q3G8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup153E9Q3G8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup153E9Q3G8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup153E9Q3G8 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup153E9Q3G8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup153E9Q3G8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup153E9Q3G8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms