Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myo5cE9Q1F5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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