Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm7158-201ENSMUST00000120079 903 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 4933427E13Rik-201ENSMUST00000044347 381 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm24161-201ENSMUST00000104592 130 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Igsf5-204ENSMUST00000113795 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm27224-201ENSMUST00000184749 564 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Olfr533-201ENSMUST00000071755 1052 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Abcc9-205ENSMUST00000204870 1458 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm14538-201ENSMUST00000122019 1327 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Crip1-205ENSMUST00000199089 509 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm30619-201ENSMUST00000213962 686 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Tmx2-202ENSMUST00000111664 1926 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 A430073D23Rik-201ENSMUST00000196262 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm43122-202ENSMUST00000202259 526 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 6430531B16Rik-205ENSMUST00000210254 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 AC163038.4-201ENSMUST00000224942 474 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 AC160138.2-201ENSMUST00000220255 1531 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm9458-201ENSMUST00000135273 727 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Rps27-202ENSMUST00000195998 458 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms