Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Rdh8D3Z6W3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Rdh8D3Z6W3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Rdh8D3Z6W3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Rdh8D3Z6W3 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rdh8D3Z6W3 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rdh8D3Z6W3 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rdh8D3Z6W3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rdh8D3Z6W3 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rdh8D3Z6W3 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rdh8D3Z6W3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rdh8D3Z6W3 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rdh8D3Z6W3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rdh8D3Z6W3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rdh8D3Z6W3 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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