Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm5478D3Z6R0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5478D3Z6R0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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