Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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