Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samd1D3YXK1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 B230323A14Rik-201ENSMUST00000180488 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms