Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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