Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syce3B5KM66 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms