Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms