Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms