Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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