Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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