Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tsc22d3Q9Z2S7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tsc22d3Q9Z2S7 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tsc22d3Q9Z2S7 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tsc22d3Q9Z2S7 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tsc22d3Q9Z2S7 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tsc22d3Q9Z2S7 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tsc22d3Q9Z2S7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms