Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms