Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn13Q9Z0S4 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn13Q9Z0S4 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn13Q9Z0S4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn13Q9Z0S4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn13Q9Z0S4 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn13Q9Z0S4 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn13Q9Z0S4 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn13Q9Z0S4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn13Q9Z0S4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn13Q9Z0S4 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn13Q9Z0S4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn13Q9Z0S4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn13Q9Z0S4 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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