Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms