Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms