Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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