Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms