Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC8

Tomm20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20Q9DCC8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm20Q9DCC8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms