Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Pdzd9Q9D9M4 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Pdzd9Q9D9M4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Pdzd9Q9D9M4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Pdzd9Q9D9M4 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pdzd9Q9D9M4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pdzd9Q9D9M4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pdzd9Q9D9M4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pdzd9Q9D9M4 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Pdzd9Q9D9M4 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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