Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Gtf3c6Q9D8P7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Gtf3c6Q9D8P7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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