Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc52a2Q9D8F3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms