Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms