Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms