Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccdc167Q9D162 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc167Q9D162 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms