Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms