Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Pfdn1Q9CWM4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Pfdn1Q9CWM4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Pfdn1Q9CWM4 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Pfdn1Q9CWM4 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Pfdn1Q9CWM4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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