Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms