Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms