Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
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Rab5aQ9CQD1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
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