Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Chmp3Q9CQ10 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Chmp3Q9CQ10 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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Chmp3Q9CQ10 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Chmp3Q9CQ10 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Chmp3Q9CQ10 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Chmp3Q9CQ10 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Chmp3Q9CQ10 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Chmp3Q9CQ10 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Chmp3Q9CQ10 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Chmp3Q9CQ10 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Chmp3Q9CQ10 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Chmp3Q9CQ10 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Chmp3Q9CQ10 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Chmp3Q9CQ10 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Chmp3Q9CQ10 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Chmp3Q9CQ10 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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