Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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