Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Brms1Q99N20 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Brms1Q99N20 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Brms1Q99N20 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Brms1Q99N20 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Brms1Q99N20 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Brms1Q99N20 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Brms1Q99N20 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Brms1Q99N20 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Brms1Q99N20 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Brms1Q99N20 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Brms1Q99N20 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Brms1Q99N20 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Brms1Q99N20 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Brms1Q99N20 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Brms1Q99N20 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Brms1Q99N20 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Brms1Q99N20 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Brms1Q99N20 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Brms1Q99N20 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Brms1Q99N20 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Brms1Q99N20 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Brms1Q99N20 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Brms1Q99N20 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Brms1Q99N20 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms